1973
- Accord sur la compensation financière relative aux frontaliers travaillant à Genève signé le 29 janvier 1973 entre le Conseil fédéral suisse agissant au nom du Canton de Genève et le Gouvernement de la République française
Une Commission mixte consultative franco-suisse est alors constituée pour gérer les problèmes de voisinage entre la République et le canton de Genève et les Départements limitrophes de l'Ain et de la Haute-Savoie :
- Echange de lettres entre la Confédération Suisse et la République Française en date du 12 juillet 1973
Cette Commission, (qui se réunit en principe une fois par an), confie à un comité plus proche des réalités du terrain, le soin de développer les coopérations transfrontalières dans différents domaines. Le comité rend compte régulièrement de ses travaux à la commission.

1974
- Première réunion du Comité, le 17 juin 1974, à Genève sous la dénomination de Comité Régional Franco-Genevois (CRFG).
Lorsque le CRFG a été créé, il n'existait alors aucun cadre juridique de coopération transfrontalière. Il constituait, à l'époque, la seule possibilité, pour gérer les problématiques transfrontalières, en associant en son sein les Etats aux côtés des collectivités territoriales.

1987
- Création du Conseil du Léman, par convention, signée à Lausanne le 19 février 1987, avec l'approbation des deux Etats. Le Conseil du Léman réunit les cantons de Genève, du Valais et de Vaud côté suisse ainsi que les Départements français de l'Ain et de la Haute-Savoie.

1994
- Protocole de coopération entre le CRFG et le Conseil du Léman du 19 décembre 1994. Ce protocole implique une concertation et une collaboration sur tous les sujets d'intérêt commun et à caractère transfrontalier entre les deux institutions notamment dans les domaines de l'aménagement du territoire, l'environnement, le logement, la culture, l'enseignement et le sport.
Depuis le début des années 2000, le CRFG s'est élargi dans sa composition et a pris une nouvelle dimension avec le lancement du projet d'agglomération franco-valdo-genevois.

2004
- Adhésion du Conseil régional Rhône-Alpes au sein du CRFG

2006
- Intégration du Projet d'agglomération franco-valdo-genevois au sein du CRFG dont la structure de pilotage est assimilée à une commission à part entière du CRFG.
- L'Association régionale de coopération des collectivités du Genevois (ARC) devient membre à part entière du CRFG.

2007
- Réorganisation des commissions du CRFG : l'ex-commission « Déplacements et sécurité » se scinde en deux et devient la commission « Déplacements » et la commission « Sécurité et règlementation générale ». L'ex-commission « Aménagement du territoire, logement et environnement » devient la commission « Logement et environnement ». L'aménagement du territoire devient partie intégrante du projet d'agglomération.
- Adhésion du Canton de Vaud (au titre plus particulièrement de la Région de Nyon) au sein du CRFG.

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